金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤二十六:mNGS大顯神威,助力結核性腦膜炎患者揪出病原

  • 分類:診斷案例
  • 作者:
  • 來源:
  • 發布時間:2020-10-26 10:44
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【概要描述】 患者男,62歲,因“排尿困難8天,發熱1周”入院,取腦脊液送檢mNGS24h后,NGS結果回報,結核分支桿菌復合群, 174條序列。

金匙醫學案例追蹤二十六:mNGS大顯神威,助力結核性腦膜炎患者揪出病原

【概要描述】 患者男,62歲,因“排尿困難8天,發熱1周”入院,取腦脊液送檢mNGS24h后,NGS結果回報,結核分支桿菌復合群, 174條序列。

  • 分類:診斷案例
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  • 發布時間:2020-10-26 10:44
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詳情

  1、病史及主訴

 

  患者丘先生,男,62歲,因“排尿困難8天,發熱1周”與2020-06-08入院。患者8天前無明顯誘因出現排尿困難,伴下腹脹痛、尿頻、尿痛,1周前出現發熱,體溫38℃,1天前下腹脹痛加劇,于我院急診就診,查尿常規、血常規提示輕度感染,予導尿后導出尿液3000ml,其后患者出現持續意識障礙。

 

  2、診治過程

 

  2020-06-08患者在急診導尿后突發意識障礙,立即收入外科ICU,專科體查提示:淺昏迷,痛刺激有痛苦表情,雙側瞳孔直徑2mm,對光反射遲鈍,急查頭顱CT提示腦積水。立即請神經科ICU會診,考慮患者有前驅發熱病史,建議完善MR和腰穿腦脊液檢查,神經外科解決腦積水。6-17行頭顱MR檢查提示:雙側大腦、腦溝、腦池及腦干邊緣多發異常信號,考慮腦膜腦炎改變,并幕上梗阻性腦積水,間質性腦水腫。6-19行腰椎穿刺術,細胞數900(10^6/L),蛋白(4655.3mg/L),糖小于1.0mmol/L,氯123mmol/L,同期血糖8.2mmol/L,血氯110mmol/L。6-21第一次腦脊液NGS回報結核分支桿菌(序列數108),立即請胸科醫院會診后給予四聯抗結核治療,6-24轉神經科ICU進一步治療。

 

  轉入時體格檢查:體溫36.5℃,脈搏80次/分,呼吸20次/分,血壓109/72mmHg,全身皮膚黏膜無黃染,頸軟,淺表淋巴結未及腫大;呼吸規整,雙肺呼吸音粗,雙肺未聞及濕啰音,無胸膜摩擦音;心率80次/分,律齊,各瓣膜聽診區未聞及病理性雜音,無心包摩擦音。

 

  專科體查:淺昏迷,痛刺激有痛苦表情,雙側瞳孔直徑2.5mm,對光反射遲鈍,四肢腱反射活躍,腦膜刺激征(+/-)。

 

  轉入后查血常規:白細胞9.74*10^9/L,N93.3%,紅細胞1.97*10^12/L ,血紅蛋白65g/l, 血小板200*10^9/L,淋巴細胞計數0.41*10^9/L;白蛋白31.48 g/l, CRP 25.66 mg/l,Na 132mmol/L,K3.81 mmol/L,PCT 8.56 ng/ml。

 

  轉入后繼續予標準四聯抗結核治療,繼續查找可能病因,積極控制肺部感染,中性粒細胞比及PCT明顯升高,羅氏芬升級為美平抗感染,請神經外科協助手術處理腦積水,外科建議先明確積水原因,請胸科醫院隨診是否中樞神經系統結核感染。胸科醫院會診后認為T-sport不支持結核感染急性期,患者意識障礙原因待查,不排除病毒引起的免疫性損害,予腰穿送檢腦脊液mNGS。

 

  3、現行治療方案與效果

 

  轉入后一直予美平2.0g Q8h靜脈滴注,并四聯抗結核治療(利福平450mg QD+吡嗪酰胺0.75g QD+異煙肼片0.3g QD+乙胺丁醇0.75g QD)。患者感染指標逐漸下降,但始終處于中昏迷狀態,床邊量化腦電圖監測提示腦電以彌漫慢波為主,a變異2分,提示皮層功能減低,光譜熵50-60,提示意識狀態昏迷,與臨床觀察一致。

 

  細菌室:腦脊液及痰抗酸染色、病原學培養、涂片鏡檢、真菌葡聚糖監測、曲霉菌及隱球菌等檢查未見明顯異常。

 

  結核抗體:陰性

 

  6-24結核干擾素釋放試驗:結核分支桿菌特異性細胞免疫反應(+),對照反應(P)10.821,刺激(T)1.248,基礎(N)0.101;(T/N)/(P/N)<1/3,不支持急性期結核活動。

 

  6-29復查腰穿:細胞數86(10^6/L),蛋白1411.5(mg/L),糖4.0mmol/L,氯107mmol/L,同期血糖8.2/mmol/L,血氯110mmol/L。

 

  6-30請胸科醫院會診后,考慮病毒感染不能排除,為進一步明確診斷,予7-1再次行腰椎穿刺術,細胞數123(10^6/L),蛋白1417.9mg/L,糖3.0mmol/L,氯104mmol/L,同期血糖6.2mmol/L,血氯91mmol/L。

 

  7-3頭顱及頸胸腰椎MR提示:雙側大腦小腦、腦干及腦表面多發異常信號,并幕上梗阻性腦積水,間質性腦水腫;頸腰椎退行性變。

 

 

  4、mNGS檢查

 

  送檢24h后,NGS結果回報:檢出,結核分支桿菌復合群, 174條序列。

 

 

  5、治療方案與效果

 

  復查頭顱MR提示:結合腦脊液NGS結果、查血結果、頭顱MR等相關輔助檢查, 考慮結核性腦膜腦炎伴梗阻性腦積水。治療上傳統四聯抗結核治療效果不佳,顱內病變進展,需聯合鞘內注射抗結核藥物并外科改善梗阻性腦積水,予轉胸科醫院繼續治療。隨訪了解患者7-21復查頭顱MR提示病灶縮小,強化抗結核治療有效。

 

  6、治療體會

 

  中樞神經系統結核感染癥狀多變,早期缺乏特征性影像改變及全身其他部位結核感染證據,傳統的結核檢驗手段如細菌培養、抗體、涂片、T-sport等檢測耗時長、敏感性、特異性不足的特點,尤其是難以判斷結核的現癥感染,經過診斷性抗TB治療的患者腦脊液也可以不典型,mNGS檢測的敏感性、特異性和時效性遠好于傳統檢測手段,在mNGS中,結核分支桿菌檢出陽性,尤其是在傳統檢測陰性情況下,可為臨床判斷結核感染提供重要證據,為后續治療的決策具有決定性意義。

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  關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于北京、天津、上海、廣州,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。

 

  金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。并與多家頂級臨床院所深入合作,發表4篇高分SCI文章。在新型冠狀病毒疫情期間,金匙醫學聯合四川大學華西醫院開展SARS-Cov-2變異分析研究,并在國際病毒學權威雜志Journal ofVirology發表合作研究論文。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、首都醫科大學附屬北京同仁醫院、四川大學華西醫院、中國醫學科學院血液學研究所血液病醫院、河南省腫瘤醫院、陸道培醫療集團等頂級院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗、重癥、感染等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

  金匙醫學開發的“新型冠狀病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗體檢測試劑盒(膠體金法)”、“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)”和“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(可逆末端終止法)”均已取得CE準入資格。2020年7月,金匙醫學研發的病原微生物測序數據分析軟件”成功獲得醫療器械注冊證,該軟件提供包括細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體、病毒以及真菌的最全類別病原信息,將為臨床感染性疾病的診治提供重要且更為全面的參考。

 

  金匙醫學已獲得國家級科技型中小企業、天津市雛鷹企業、天津市戰略性新興產業領軍企業等榮譽稱號;在CHC醫療咨詢聯合中信證券在線發布的“2019年度中國醫療大健康產業投融資榮譽榜”中榮獲“中國醫療健康產業最佳新銳獎”;在“2020年中關村國際前沿科技創新大賽”中榮登“病毒檢測技術專場TOP10榜單”。

 

 

 

 

 

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